É consenso que a manifestação de 1 ou mais de 2 sintomas apresentados abaixo indicam a remoção do dente impactado, já a conduta para remoção profilática de terceiros molares deve ser avaliada, pois a maioria de patologias descritas estão associadas ao dente parcialmente erupcionado, e em dentes impactados totalmente em osso há menor incidência destes problemas. Segundo Peterson, estas são as principais indicações para remoção do terceiro molar.

1) Prevenção ou tratamento de Pericoronarite
Potencial de processo inflamatório leve/moderado. Em algumas situações uma grave infecção que pode requerer vigoroso tratamento medicamentoso ou cirúrgico. Bactérias comumente associadas: Peptostreptococcus,Fusobacterium, and Bacteroides. Tratamentos: debridamento da bolsa periodontal por irrigação com peróxido de hidrogênio ou clorexidina e remoção cirúrgica. Casos severos de pericoronarite com sintomatologia sistêmica pode requerer antibioticoterapia. Prevenção de pericoronarite recorrente é resolvida com a extração do dente envolvido na infecção. Aproximadamente 25% a 30% dos 3ºMI são removidos devido à pericoronarite, também é a indicação mais frequente de remoção de dentes impactados para pacientes com mais de 20 anos de idade.

2) Prevenção de doença dental
Cárie pode acometer o próprio dente impactado e o adjacente. Cárie é responsável pela extração em aproximadamente 15% dos pacientes. A presença de dentes parcialmente impactados e a incapacidade do paciente de higienizar a região resulta em doença periodontal avançada, essa é a indicação de aproximadamente 5% dos terceiros molares impactados.

3) Razões ortodônticas
Apinhamento dos incisivos inferiores: é motivo de controvérsia como indicação dos terceiros molares inferiores, a literatura recente aponta que o apinhamento mandibular anterior está associada a discrepância do tamanho do arco. Obstrução de movimentação: em algumas situações o ortodontista necessita distalizar o 2ºM, mas a presença do 3ºM pode diminuir ou até cessar essa movimentação. Interferência com cirurgia ortognática: quando osteotomia maxilar ou mandibular é necessária, remoção do dente impactado pode facilitar o procedimento ortognático.

4) Prevenção de tumores e cistos odontogênicos
No terceiro molar impactado que é deixado na mandíbula, o saco pericoronário que foi responsável pela formação da coroa pode passar por uma degeneração cística e formar um cisto dentígero. O saco pericoronário pode evoluir para um tumor odontogênico e, em raros casos, um tumor maligno. Essas possibilidades têm cido citadas na literatura como uma razão para a remoção dos dentes impactados assintomáticos, pois apesar de raro, quando ocorre a patologia pode oferecer um sério risco à saúde. A incidência de uma alteração neoplásica em dentes impactados é estimada em torno de 3%. Por volta de 2% dos terceiro molares extraidos são devido a presença de cistos e tumores odontogênicos. Essas alterações patológicas são usualmente vistas em pacientes abaixo de 40 anos, sugerindo que o risco de alterações neoplásicas de 3º molares pode diminuir com a idade.

5) Reabsorção radicular de dentes adjacentes
O terceiro molar em processo de erupção pode causar reabsorção dos dentes adjacentes, assim como um dente permanente reabsorve a raíz de um dente decíduo. A recorrência de reabsorção significante é de 7%, assim ao notar-se a reabsorção em dente adjacente a extração do dente impactado deve ser feita assim que possível, pois na maior parte dos casos o dente adjacente é reparado com a deposição de uma camada de cemento na área reabsorvida e a formação de dentina secundária.

6) Dentes sobre próteses
Antes da confecção de uma prótese fixa ou removível, deve-se ter certeza que não há dentes impactados sobre a prótese, se há algum dente impactado presente a recomendação é a de remoção. Porém dentes totalmente cobertos por osso, que não demonstram alteração patológica e em pacientes com mais de 40 anos são propensos a não acarretar nenhum tipo de problema. Entretanto se há protese apoiada sobre a mucosa, e há um dente coberto por 1 a 2 mm de osso ou apenas tecido mole, é muito possível que com o tempo ocorra reabsorção do osso alveolar, a mucosa será perfurada e a área ficará dolorida e inflamada. Caso isso ocorra, o dente deverá ser removido e a prótese alterada ou confeccionada novamente. Cada situação deverá ser observada e avaliado o risco-benefício.

7) Prevenção de fratura mandibular
Pacientes que participam de esporte de contato (futebol, rugby, artes marciais e outros) devem considerar a extração de seus terceiro molares para previnir fratura mandibular durante alguma competição. Um terceiro molar inferior impactado apresenta uma área de menor resistência óssea que repercute em um sítio comum de fratura. Um dente impactado na linha de fratura também prejudica o tratamento da fratura.

8) Tratamento de dor de origem desconhecida
Ocasionalmente pacientes queixam-se de dor mandibular de origem desconhecida na área de terceiro molar inferior que não possue nenhum sinal clínico ou radiográfico de patologia. Nessas situações a remoção do terceiro molar impactado pode cessar a sintomatologia, aproximadamente 2% dos 3ºMI são removidos com esta indicação. Quando um paciente têm esse tipo de sintomas, é fundamental descartar qualquer patologia.